Theo phóng viên người Ý Schilla, Empoli từng mời Nesta về huấn luyện đội nhưng bị Nesta từ chối.
Schilla tiết lộ rằng Empoli đã cố gắng thuyết phục Nesta tiếp quản đội bóng, nhưng Nesta đã từ chối lời mời huấn luyện vì anh ấy không hài lòng với dự án của câu lạc bộ. Nesta vẫn đang chờ đợi cơ hội huấn luyện từ các CLB Ý hoặc CLB nước ngoài khác.
Nesta đã từng là huấn luyện viên của Frosinone, Reggiana, Monza và các đội khác.